Struktur organisasi Program Studi S1 Ilmu Tanah Fakultas Pertanian Universitas Sebelas Maret dipimpin oleh Ketua Program Studi, yaitu Dr. Ir. Hery Widijanto, S.P., M.P. yang bertanggung jawab atas pengelolaan akademik dan manajerial program studi.
Dalam pelaksanaannya, Ketua Program Studi didukung oleh Ketua Komisi Sarjana yang menangani bidang akademik, Pembina Himpunan Mahasiswa dalam pembinaan kemahasiswaan, Koordinator CDC/Magang untuk pengembangan karier dan kegiatan magang, serta tenaga administrasi program studi.
Selain itu, kegiatan akademik dan penelitian juga didukung oleh beberapa laboratorium, yaitu Laboratorium Kimia dan Kesuburan Tanah, Biologi dan Bioteknologi Tanah, Klimatologi, Fisika dan Konservasi Tanah, serta Pedologi.